Güney Deniz Saha Komutanlığı, İstiklal Harbi sonrası 1924’te İzmir Naldöken’de bir Mayın Grubu olarak kurulmuştur. İlk olarak İzmir Bahriye Komutanlığı’na bağlı olarak faaliyet gösteren birlik, 1947-1961 yılları arasında Ege Üs Komutanlığı adı altında hizmet vermiştir. 1961’de Genelkurmay Başkanlığı’nın emirleri doğrultusunda Güney Deniz Saha Komutanlığı olarak yeniden yapılandırılmıştır. Konak’taki mevcut yapının yetersiz kalması nedeniyle, 2000 yılında Yenikale/İzmir’de yeni tesislerin inşası tamamlanmış ve 2003 yılında yeni karargah binasında hizmete başlamıştır. Günümüzde, Güney Deniz Saha Komutanlığı, İzmir’de bulunan bu modern tesislerde faaliyetlerini sürdürmektedir.

Kuzey Deniz Saha Komutanlığı, Türk Deniz Kuvvetleri’nin tarihsel evriminde önemli bir yere sahiptir. 1918’deki Mondros Ateşkes Antlaşması’ndan sonra Boğazlar ve Marmara Denizi müttefiklerin kontrolüne geçti. Kurtuluş Savaşı sonrası dönemde çeşitli reorganizasyonlara uğrayan ve 1961’de Kuzey Deniz Saha Komutanlığı olarak yeniden yapılandırılan bu komutanlık, bölgesel deniz savunmasını sağlamak ve lojistik destek vermekle sorumludur. 1952’den itibaren boğaz savunması Deniz Kuvvetleri Komutanlığı’na devredilmiş, İstanbul Deniz Komutanlığı lağvedilerek Boğazlar ve Marmara Komutanlığı kurulmuştur. Günümüzde, Kuzey Deniz Saha Komutanlığı, önemli görevleri ve çeşitli alt birimleriyle Türk Deniz Kuvvetleri’nin stratejik yapısında kritik bir rol oynamaktadır.